Số liệu thống kê của Cục Hải quan cho biết, đến hết tháng 9 năm 2025, tổng kim ngạch thương mại song phương giữa Việt Nam và Nhật Bản đạt gần 38 tỷ USD. Trong đó xuất khẩu hàng hóa của Việt Nam sang Nhật Bản đạt 19,65 tỷ USD, chiều ngược lại Việt Nam nhập khẩu hàng hóa từ Nhật Bản 9 tháng năm 2025 đạt 18,24 tỷ USD. Việt Nam xuất siêu sang Nhật Bản đạt 1,41 tỷ USD.

Hiện nay, Nhật Bản là đối tác thương mại lớn thứ tư của Việt Nam. Trong các nhóm hàng xuất khẩu chủ lực, hàng dệt may dẫn đầu với kim ngạch đạt 3,36 tỷ USD, tăng 11,45% so với cùng kỳ năm 2024. Tiếp đến là phương tiện vận tải và phụ tùng, đạt 2,42 tỷ USD, tăng 1,12% so với cùng kỳ.